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Voici la pandémie du COVID-19 … vue par un·e bioinformaticien·ne.

Des traces génétiques pour suivre le voyage des virus

Vers une vision globale des épidémies

  • L’outil Nextstrain, dont est issue cette carte, montre comment les virus évoluent et circulent dans le monde. Il fait partie des nombreux outils et bases de données du Pathogen Data Network, un projet international piloté par la Suisse. Ce projet facilite le partage des données à l’échelle mondiale et utilise l’IA pour offrir une vision globale des agents infectieux – des virus aux bactéries – et mieux comprendre les risques liés aux menaces émergentes.

Un virus a une carte d’identité génétique ; chaque changement de cette carte (mutation) peut créer un variant plus contagieux ou plus ou moins dangereux.

La taille des cercles indique combien de cartes d’identités génétiques de virus une région a partagées – parfois des centaines de milliers !

Les couleurs indiquent les variants du virus ; les lignes retracent leurs voyages entre régions du monde.

La bioinformatique transforme les cartes d’identités des virus en cartes vivantes pour suivre les épidémies en temps quasi réel.

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