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Voici une tumeur … vue par un·e bioinformaticien·ne

Décoder un cancer cellule par cellule

Une carte haute résolution de la tumeur

Générées par des algorithmes, les cartographies de tumeurs cellule par cellule révèlent des profils cellulaires complexes, parfois invisibles par des méthodes classiques. Elles sont des outils puissants pour comprendre la dynamique de la tumeur, anticiper la résistance à certains traitements, ou identifier de nouvelles cibles thérapeutiques.

Les tumeurs sont en réalité des mosaïques de milliers de cellules.

Chaque point est une cellule, et chaque trait une interaction.

Chaque couleur indique un type de cellule différent :

  • Bleu : cellules cancéreuses

  • Vert : cellules immunitaires (lymphocytes T/B) infiltrés pour combattre les cellules cancéreuses

  • Rouge : fibroblastes et cellules stromales formant la charpente élastique des poumons

  • Violet : cellules musculaires péribronchiques régulant le diamètre des bronches

  • Rose : cellules epithéliales ciliées et cellules basales assurer filtration/renouvellement du tissu pulmonaire

Sur cette coupe de cancer du poumon, plus de 10 000 cellules ont été analysées et classées grâce à la bioinformatique.

Crédit illustration : Dr Marco Varrone, Département de Biologie Computationnelle (DBC), Faculté de Biologie et de Médecine (FBM), University of Lausanne (UNIL)

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